Если пользователь закроет окно Skype, эмблема Skype и значок статуса будут отображаться как на панели задач Windows, так и в области уведомлений.

Вы можете изменить параметры, чтобы приложение Skype исчезало с панели задач Windows при закрытии окна приложения кнопкой X. При этом Skype будет работать в фоновом режиме, и вы сможете принимать звонки и мгновенные сообщения. Уведомления о полученных мгновенных сообщениях будут отображаться в области уведомлений. Для этого выполните следующие действия:
Войдите в Skype.
Выберите "Инструменты" > "Настройки".
Выберите "Дополнительно" > "Расширенные настройки".
Снимите флажок "Не убирать Skype из панели задач, когда я в сети".



Нажмите кнопку "Сохранить".

Панель задач и плавающее окно Skype

Кроме того можно также отключить и назойливое плавающее окошко, которое появляется после звонка. Для этого надо сделать следующее:
Войдите в Skype.
Выберите "Инструменты" > "Настройки".
Выберите Настройки звонка и нажмите кнопку "Открыть дополнительные настройки".
Снимите флажок "Показывать кнопки управления, когда Skype работает в фоновом режиме".